巴士
路線眾多而復雜，大多以鐵路車站或重要地點為端點站或主要換乘站，主要街道上也經常可見巴士站牌;都心部的市區巴士以都營路線為主，兼有里程較長路線與短程接駁路線(如澀谷站～六本木新城)，以及幾條觀光巴士路線(如東京、銀座～臺場)。都心以外的地區巴士多由私鐵業者(東武、西武、東急等)兼營，因此經常以私鐵車站作為端點站。另外還有往返于都心部主要飯店、東京機場巴士總站(T-CAT)與成田機場、羽田機場間的“AirportLimousine”(利木津巴士)。在幾個大型轉運站(東京站、新宿站…等)附近，也有數條長途高速巴士路線，可以搭乘前往本州島各地。
出租車
在鐵路車站附近與主要街道上可以找到出租車站，而且原則上可以在任何地方搭乘出租車。當出租車前擋風玻璃左下角的信號燈顯示為紅色時，則表示這輛出租車可以搭乘。乘車時，司機會自動(車上的一個按鈕)把后門打開，上車后司機自動關門。到達目的地后，按照計價器付錢，司機自動把車門打開，乘客下車，不用關門。
電車
新交通百合鷗號(新交通ゆりかもめ)，無人駕駛電車路線，連接新橋、汐留、臺場(臨海副都心)與豐洲。
單軌鐵路
東京單軌電車(東京モノレ`ル)，連接東京國際機場(羽田機場)和市區(濱松町)。
多摩都市單軌電車(多摩都市モノレ`ル)，位于東京西邊的多摩地區。
迪士尼渡假區線(ディズニ`リゾ`トライン)，連接迪士尼樂園與迪士尼海洋樂園(單向環狀運行路線)。
地鐵
各路線都有專屬的英文字母代號，主要是與數字組合，作為各路線車站的快速辨識代號(例如東京站西北方地下的大型轉乘站-大手町站，是丸之內線與東西線的交會點，它分別為丸之內本線編號第18站，與東西線編號第9站，因此有“M18”與“T09”兩個代號)。至于專屬路線代表色，則是與車站內的導引指標用色，以及地下鐵車廂上的彩色裝飾線條配合，方便搭乘民眾辨識。
銀座線G=橘色
丸之內線M(支線代號為m)=紅色
日比谷線H=銀色
東西線T=藍色
千代田線C=綠色
有樂町線Y=金色
半藏門線Z=紫色
南北線N=翠綠色
副都心線F=棕色
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